時は西暦2041年。宇宙の彼方より現れ、地球を攻撃する謎の金属生命体ゼラバイア。その圧倒的な力に、人々はなすすべもなかったが、正体不明の大富豪クライン・サンドマン率いる武装戦隊アースガルツがこの脅威に立ち上がった。アースガルツの戦闘部隊であるグランナイツの若者たち──斗牙、エイジ、琉菜、ミヅキ、エィナ、リィル──は、4機のグランディーヴァとグランカイザーが合体して誕生するスーパーロボット、ゴッドグラヴィオンでゼラバイアとの戦いに勝利を重ねていく。そして、ゴッドグラヴィオンが最大の危機に陥ったそのとき、月より超重剣が飛来し、その窮地を救ったのであった。
　激しい戦いから数カ月後。地球は久方ぶりの平穏を取り戻していた。楽しい日常を謳歌するグランナイツの面々。そこにゼラバイアが出現し、再び熾烈な戦いの幕が上がる。

　前作『超重神グラヴィオン』は、どちらかというとエイジや斗牙らグランナイツの少年少女の活躍と成長に焦点を当てた作品であった。だがこの作品では、アースガルツの司令官サンドマンに対してスポットライトが当てられている。前作では完全無欠の大人というイメージが強かったサンドマンだが、この作品では1人の人間としてそのキャラクター性が深く掘り下げられており、時に弱さを見せつつも、最後には立ち上がり、ロボット（グランΣ）に乗って自ら戦うという正統派ヒーローの姿をも見せてくれる。その美しく勇壮な姿は、まさに真の主役といっても過言ではない説得力に満ちたものであった。
　なお、ストーリーの項目でも触れた萌え要素については、あえてエイジと斗牙の女装をトピックとしてあげておこう。前作からたびたび女装していた彼らだが、この作品では第1話から披露。しかもアイキャッチにまでなっているというありさま。非常に似合っているのが、なんとも悔しいところである。

●アースガルツ

　クライン・サンドマンが創設した、対ゼラバイアを目的とする戦闘集団。合体してゴッドグラヴィオンとなる、グランカイザーと4機のグランディーヴァを操る戦闘部隊はとくにグランナイツと呼ばれている。そのほか、オペレーターや整備班、武装班、医療班などさまざまな部署が存在しているが、所属しているのは、いずれもサンドマンが己の美学によって集めた美少女（美女）メイドたちである。
　なお、本拠地はサンドマンの居城であるサンジェルマン城。西洋風の外観（および内装）でありながら、司令室やグランディーヴァの格納塔など、メカニカルな設備が満載されている。それもそのはず、サンジェルマン城の正体は、超重戦艦グラヴィゴラスなのである。