『VALKYRIE DRIVE』プロジェクトストーリー

　世界中の10代から20代の少女たちの間で、突如として発症し始めた謎の病。それは精神的な高揚を得ると一時的に肉体組織が変容し、体全体が極めて殺傷能力の高い武器へと変わってしまうというものだった。

　検査の結果、原因はとある特殊なウイルスによるものであることが判明。姿を武器化してしまうその症状からウイルスは“A（アームド）-ウイルス”と名付けられ、ウイルスによって武器化を発症した少女たちは“アーム”と呼ばれるようになった。

　また“A-ウイルス”の感染者の増加とともに、アームとは違う症状を発症する少女たちが現れ始める。彼女たちはアームの武器化症状を加速させ、自在にコントロールする力を持っていた。

　やがて、アームとして自身を武器化させることのできる少女たちのことを“エクスター”、 アームを自在に操り、扱うことができる少女たちのことを“リブレイター”と呼ぶようになり、対を成す存在として注目されていくことになる。

　しかし数年の月日が流れ、エクスターとリブレイターによる犯罪が増え、非合法な組織や果てには軍隊までもが彼女たちを利用しようとする。

　武器化したエクスターが有する圧倒的とも言える破壊力は脅威であり、その力を自由に振るうことのできるリブレイターもまた同様であった。

　事態を重く見た世界政府は、犯罪の有無に関わらずA-ウイルスの感染者の保護を目的とした法案を成立。秘密裏に世界の洋上に5つの人工島を建設し、表向きには保護という名目で、感染者たちを隔離してしまう。

　そして人工島へのA-ウイルス感染者たちの隔離・移送が開始されてから5年。それぞれの島を舞台に少女たちの戦いが幕を開ける。