【ストーリー】

　今や世の中の出来事はすべてプログラム化されており、“プロミン”と呼ばれる不思議なモンスターのおかげでこの世の中の仕組みは動いていた！

　実は身の回りで起こる不具合（バグ）は、プロミンがバグ化した"バグミン"の仕業だったのだ！　このままバグミンを放っておけば、いつか大事になるかもしれない……。

　少年ユートは突然現れた宇宙犬ワンダと出会い、カメラ型をはじめさまざまなキーアイテムを駆使してさまざまなバグミンの捕獲に乗り出す！

　プロミンはそれぞれ、“モノを加速させる”、“炎を出す”、“モノを作り出す”など、“カミワザ”と言われる特別な能力をもっており、迫り来るバグミンに〝カミワザ″を繰り出して対抗する！

　最初は身の回りのイタズラ程度だったバグミンによる被害も、どんどん大きくなってやがて地球規模に……果たして1人と1匹は地球を救うことができるのか!?